وضعیت سودآوری این شرکت طی سال‌های 90-95 روند رو به رشدی پرشتابی داشته‌است اما ارقام سود چندان چشمگیر نیستند. زیان 202 میلیون تومانی این شرکت در سال 90 به سود 553 میلیون تومانی سال 91، 351 میلیون تومان در سال 92، 3 میلیارد تومان در سال 93، 5 میلیارد تومان در سال 94 و نهایتا 7.4 میلیارد تومان در سال 95 رسیده است (157 ریال به ازای هر سهم).
در حال حاضر شرکت ریل‌سیر کوثر انحصار قطارهای مسافری مسیرهای بندرعباس-مشهد و یزد-مشهد را در اختیار دارد. قراردادهای این شرکت در زمینه باری و مسافری به ترتیب 31 ماهه (شروع قرارداد از آذر 93) و 30 ساله (شروع قرارداد از اسفند 84) هستند. بر این اساس ریسک قراردادهای کوتاه‌مدت برای این شرکت از بین خواهد رفت. نگاهی به تفکیک درآمدهای قراردادی این شرکت در زمینه باری و مسافری نشان می‌دهد که با توجه به عقد قرارداد جدیدتر در زمینه باری، رشد درآمدها از این محل با شتاب بیشتری صورت گرفته است. به عنوان مثال مقایسه درآمدهای شرکت در سال 95 نسبت به سال 94 نشان دهنده رشد 62 درصدی (11 درصد از منظر نرخ بارنامه و 52 درصد از منظر تعداد بارنامه) مبلغ درآمدهای باری(از محل حمل نفت) و رسیدن آن به سطح 22.8 میلیارد تومان است. در مقابل درآمدهای شرکت از محل واگن‌های مسافری در سال 95 نسبت به سال 94 رشدی 46 درصدی را نشان می‌دهد (9.5 درصد از محل متوسط نرخ فروش بلیط و 36 درصد از محل تعداد بلیط فروخته شده). افزایش درآمدهای شرکت از محل واگن‌های مسافری با فرض افزایش 10 واگن مسافری از ابتدای سال 95 در نظر گرفته شده‌است. درآمد شرکت از این محل در سال 95 معادل 31.8 میلیارد تومان است.
سهم راه‌آهن از درآمدهای واگن‌های باری و مسافری به ترتیب 51 و 40 درصد در نظر گرفته شده‌است که بزرگترین قسمت بهای تمام شده خدمات ارائه شده را شامل می‌شود. (56 درصد از کل بهای تمام شده کالای فروش رفته و خدمات ارائه شده در سال 95).
گزارش‌های شرکت با توجه به قراردادهای ثابت مطابق با برنامه‌های پیش‌بینی شده پیش می‌رود. براین اساس 68 درصد از درآمدهای پیش‌بینی شده در سال 95 تا پایان آبان‌ماه محقق شده است (براساس برنامه چیزی در حدود 67 درصد باید محقق می‌شد). تمام مفروضات و شرایط نشان از توانایی شرکت به پوشش سود پیش‌بینی شده دارد
